معاونت اجرایی عهده دار برنامه ریزی، توسعه و پشتیبانی منابع انسانی، اداری و مالی پژوهشگاه است. این معاونت در هماهنگی با معاونت پژوهشی پژوهشگاه و پژوهشکده ها در جهت تحقق اهداف پژوهشی پژوهشگاه تلاش می کند.

این معاونت از سه بخش امور اداری، امور مالی و امور فناوری اطلاعات تشکیل شده است.

امور اداری پژوهشگاه متولی برنامه ریزی و اجرای قوانین، مقررات و مصوبات اداری، پشتیبانی فعالیت های پژوهشی، سازماندهی و نظارت جذب و استخدام نیروی انسانی است. انجام امور رفاهی کارکنان، بیمه تکمیلی کارکنان و خانواده ها،  تعمیرات و نگهداری و  پشتیبانی فنی از دیگر وظایف این اداره می باشد.

امور مالی بر اساس قوانین و مقررات مالی محاسباتی، مسئولیت کنترل بر منابع، مصارف و اعمال قوانین و مقررات و تطبیق آن با پرداخت ها و تامین اعتبار را بر عهده دارد. معاونت اجرایی در این بخش در چگونگی مصرف وجوه و تخصیص بهینه منابع مالی نقش به سزایی داشته و برنامه ریزی مالی انجام می دهد. تاسیس صندوق قرض الحسنه پژوهشگاه از دستاوردهای این حوزه بوده است.

آماده سازی بسترهای نرم افزای و سخت افزاری در حوزه فناوری اطلاعات نیز در واحد فناوری پژوهشگاه انجام می گیرد. علاوه بر این طراحی و پشتیبانی از وبگاه پژوهشگاه از دیگر اقدامات این بخش می باشد.

معاون اجرایی: سیده راحله رودکی 

همکاران معاونت اجرایی:

• اعظم آزاد (مدیر امور مالی)
• محمد علیپور (معاون امور مالی)
• مسعود احمدی (سرپرست امور اداری)
• اصغر رضایی (کارشناس کارگزینی)
• حسین بهروز قاضیانی (کارشناس مسئول فناوری اطلاعات)
• عباس محمدی (کارشناس فناوری اطلاعات)
• امیر نظری (کارپرداز و مسئول خدمات)
• صغری مغان (کارشناس بودجه)
• کریم احمدی (کارشناس هماهنگی و پیگیری اجرایی)
• امیر فیروز کلایی (مسئول دبیرخانه)